As estirpes microbióticas estão naturalmente presentes na alimentação e principalmente em alimentos fermentados como iogurte, chucrute, pickles, ...
Existem muitas estirpes microbióticas.
São identificadas pelo seu género, espécie, subespécie e por carateres alfanuméricos que permitem que sejam especificamente designados.
Exemplo: Lactobacillus casei LC03
World Gastroenterology Organisation – World Gastroenterology Organisation Global Guideline - Probiotique et prébiotiques. Disponível em: https://www.worldgastroenterology.org/guidelines/global-guidelines/probiotics-and-prebiotics/probiotics-and-prebiotics-french. Consultado a 14 dezembro de 2020.